وی افزود: این موزه روایتگر بخشی از تاریخ پرفرازونشیب انقلاب اسلامی در مقابله با سازمان مجاهدین خلق (منافقین) است و تلاش دارد با اتکا به اسناد معتبر تاریخی، ابعاد مختلف عملکرد این گروهک تروریستی را برای مخاطبان تبیین کند.

سخنگوی شهرداری تهران با اشاره به ویژگی‌های این مجموعه گفت: موزه «اسرار سازمان» برای نخستین‌بار در کشور و در فضایی به مساحت حدود ۷۰۰ متر مربع ایجاد شده و تاریخچه این سازمان را از زمان شکل‌گیری در دهه ۱۳۴۰ تا شکست مفتضحانه آن در عملیات مرصاد در سال ۱۳۶۷، به‌صورت مستند و بازسازی‌شده در معرض دید عموم قرار می‌دهد.

محمدخانی تصریح کرد: در بخش‌های مختلف این موزه، سرفصل‌هایی همچون مبانی و ریشه‌های فکری و تشکیلاتی منافقین، اعلام جنگ مسلحانه علیه نظام و مردم، عملیات‌های ترور و بمب‌گذاری، جاسوسی و همکاری با ارتش بعثی عراق، با بهره‌گیری از اسناد تاریخی، آثار تصویری، هنر محیطی، بازسازی صحنه‌های واقعی و نمایش فیلم بازنمایی شده است.

سخنگوی شهردار تهران گفت: طراحی و تحقیق این مجموعه توسط جواد موگویی، پژوهشگر و مستندساز حوزه تاریخ انقلاب اسلامی انجام شده و هدف اصلی آن، ایجاد فضایی پژوهشی و در عین حال جذاب برای تبیین مظلومیت ملت ایران در مواجهه با تروریسم سازمان‌یافته است.