مظفریان درباره شرایط گونه‌های جنگلی ایران هم به طغیان آفات و بیماری‌ها اشاره کرده و می‌گوید: ما متاسفانه در سال‌های گذشته بخش بزرگی از جنگل‌های شمشاد خزری را به علت آفات و بیماری‌ها از دست دادیم. امروز هم با این اپیدمی که پیش آمده است و با تغییرات سطح زمین و بی‌مبالاتی درباره جنگل و اینکه هر لحظه شاهد آتش‌سوزی و مسایلی از این دست هستیم، دیگر هرچیزی ممکن است در معرض خطر نابودی قرار بگیرد. 

او یکی از گونه‌های جنگلی در معرض نابودی را بلندمازو (Quercus castaneifolia) اعلام می‌کند و بر این باور است که امروز نه تنها جنگل‌های خزر بلکه ناحیه زاگرس هم هر لحظه در معرض نابودی است. زیرا نگاه ما، نگاه بهره‌برداری غلط از منابع است.